2013～2014年上饶市甲1亚型流感病毒HA1基因特性的分析(2)

http://www.100md.com 2015年9月25日 中国当代医药2015年第27期

     1.5 引物和核苷酸序列测定

    引物1：5′-AGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAA-CC-3′；引物2：5′-CAATGAAACCGGCAATGGCTCC-3′[5]。引物由上海生物工程技术服务有限公司合成，PCR产物序列测定送上海生物工程技术服务有限公司。

    1.6 基因序列分析

    氨基酸和核苷酸分析采用DNAStar 5.0、Mage 4.0序列分析软件，将WHO北半球新型甲型H1N1流感疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)的HA1基因序列作为参比分析。

    2 结果

    2.1 2013～2014年上饶市流感病毒的分离情况

    2013～2014年共分离鉴定流感病例样本2273件，分离到甲1亚型流感病毒47株。其中2013年分离鉴定流感病例样本1204件，分离到甲1亚型流感病毒26株；2014年分离鉴定流感病例样本1069件，分离到甲1亚型流感病毒21株。

    2.2 氨基酸和核苷酸序列的分析结果

    随机抽取10株甲1亚型流感病毒进行HA1区核苷酸序列检测，选2013年分离的毒株4株，2014年分离的毒株6株。对HA1基因PCR产物经核苷酸序列测定、序列拼接后 ......