连作对黄花蒿生长及土壤细菌群落结构的影响(3)
23土壤细菌
231土壤细菌16S rRNA稀释曲线随机抽取测序样品中的16S rRNA读数(reads)，以细菌属(或种)数(OTUs)为纵坐标，16S rRNA读数为横坐标，获得细菌稀释曲线(图1)。由图可见，16S rRNA读数超过5000，即OTUs值达到600后，曲线逐渐趋于平缓，说明测序量达到饱和，PCR扩增的序列数可以反映土壤生态系统中的细菌群落组成。此外，稀释曲线OTUs的最大值和序列数(Reads)均因黄花蒿栽培年限不同而异，OTUs最大值Y3 > Y5 > Y0 > Y1；序列数的最大值则为Y0和Y3最大，Y1和Y5次之。
232土壤细菌门类高通量测序依次从Y0，Y1，Y3，Y5土样中获得了16 625，10 944，15 665，10 778个细菌16S rRNA序列(Reads)，分别代表742，634，812，731种细菌(OTUs) ......
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231土壤细菌16S rRNA稀释曲线随机抽取测序样品中的16S rRNA读数(reads)，以细菌属(或种)数(OTUs)为纵坐标，16S rRNA读数为横坐标，获得细菌稀释曲线(图1)。由图可见，16S rRNA读数超过5000，即OTUs值达到600后，曲线逐渐趋于平缓，说明测序量达到饱和，PCR扩增的序列数可以反映土壤生态系统中的细菌群落组成。此外，稀释曲线OTUs的最大值和序列数(Reads)均因黄花蒿栽培年限不同而异，OTUs最大值Y3 > Y5 > Y0 > Y1；序列数的最大值则为Y0和Y3最大，Y1和Y5次之。
232土壤细菌门类高通量测序依次从Y0，Y1，Y3，Y5土样中获得了16 625，10 944，15 665，10 778个细菌16S rRNA序列(Reads)，分别代表742，634，812，731种细菌(OTUs) ......
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