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编号:12618510
红腺忍冬绿原酸生物合成新基因克隆及其生物信息学分析(2)
http://www.100md.com 2015年3月1日 中国中药杂志 2015年第5期
     苯丙氨酸生物合成途径上编码酶基因均属不同的基因家族,本课题组前期利用从头转录组测序获得了忍冬绿原酸生物合成途径上的PAL,4CL,C4H,HQT基因家族成员[6],并筛选获得LJPAL1表达量可能与绿原酸积累密切相关。在此基础上,初步建立了基于LJPAL1多克隆抗体的酶联免疫检测技术,用于评价金银花种质资源[7]。

    与忍冬相比,红腺忍冬花蕾和叶中绿原酸分布不同。本课题组克隆了红腺忍冬LHPAL1,LHPAL2,LHPAL3,LHHQT基因,并对忍冬和红腺忍冬直向同源基因在花蕾,叶中的转录情况进行了比较,推测直向同源基因PAL2,4CL2,FNS2转录水平的种间差异可能是导致化学成分变异的原因之一[6]。在此基础上,本文利用红腺忍冬基因组数据获得了4个新的同源基因LHPAL4,LHHCT1,LHHCT2,LHHCT3,并对其在红腺忍冬不同组织中的表达模式进行分析,以期为红腺忍冬绿原酸生物合成关键酶基因家族成员结构与功能多样性研究提供基础。

    1 材料与方法

    1.1 基因预测 利用BLASTx 软件分别以忍冬PAL ......
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