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编号:13570975
KIF4A在乳腺癌中的功能分析及临床意义(2)
http://www.100md.com 2018年12月1日 《新医学》 201812
     材料与方法

    一、 数据收集

    利用Bioconductor/TCGAbiolinks函数包从肿瘤基因图谱TCGA数据库下载并预处理乳腺癌数据集的mRNA表达数据,在人类蛋白图谱数据库中验证KIF4A蛋白在乳腺癌中的表达水平,利用Kaplan?Meier Plotter在线分析KIF4A与乳腺癌患者预后的相关性。利用Chipbase在线分析基因表达相关性。

    二、KIF4A的相关基因分析

    通过TCGA数据库分析KIF4A基因在乳腺癌组织中具有相关性的基因群,设置相关系数>0.4或<-0.4,筛选出638个基因,进一步通过DAVID分析软件对KIF4A具有相关性的基因群进行KEGG和GO分析。

    三、统计学处理

    采用SPSS 17.0分析数据。计量资料以x±s表示,2组间比较采用独立样本t检验,基因表达之间的关系采用Pearson相关分析,生存分析采用Kaplan?Meier Plotter。P<0.05为差异有统计学意义。

    结 果

    一、KIF4A基因在乳腺癌中的表达

    利用TCGA数据库的数据分析了KIF4A基因在113名正常人的乳腺组织、1 090例乳腺癌患者中mRNA的表达情况 ......
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